Năm học 2019-2020, Liên đội đã thành lập câu lạc bộ Chỉ huy đội nhưng vì còn non trẻ nên chưa thu hút được nhiều đội viên tham gia. Sang năm học 2020-2021, câu lạc bộ vẫn được duy trì nhưng nâng chất hơn, với nhiều hoạt động phong phú hơn, duy trì sinh hoạt vào giờ ra chơi sáng thứ hai, tư, sáu hằng tuần. Chủ nhiệm câu lạc bộ là cô Tổng phụ trách Đội, sau khi tốt nghiệp lớp đào tạo chức danh tổng phụ trách đội tháng 12 năm 2020, cô đã định hướng được hoạt động của câu lạc bộ có chiều sâu hơn. Bên cạnh đó, 6 thành viên trong câu lạc bộ cũng đạt thành tích Chỉ huy đội giỏi cấp quận năm học 2020-2021.
